2011 年 2 月 2 日,北京——安捷倫科技公司(紐約證交所:A)今日推出了首款商業化 RNA 靶向序列捕獲系統——SureSelect RNA 捕獲試劑盒,讓基因學家能夠集中精力研究所關注的特定基因座或轉錄本。RNA 捕獲試劑盒能夠精確測定目標基因的表達水平,還能檢測等位基因的特異性表達、剪接事件以及基因融合。
這一劃時代的產品基于Broad研究所 Joshua Levin 等的工作成果,標志著安捷倫與Broad的科研人員長期合作所取得的最新進展。
日本Jichi醫科大學及東京大學教授Hiroyuki Mano博士說道:“安捷倫 SureSelect RNA 捕獲系統提高了癌癥研究中 RNA 測序的效率,是在我們的腫瘤 cDNA 文庫中尋找新融合基因的重要工具。正是由于在肺癌中發現了 EML4-ALK 突變,才有了 ALK 阻斷劑的發明,該類藥物可望具有很好的治療前景。我們相信,對新型治療靶點例如致癌融合基因的研究,也能夠促進針對其他癌癥的個體化藥物的開發。”
多組學分析能力
使用該新型 RNA 捕獲試劑盒,科研人員通過一次實驗便可得到目標基因組和轉錄組的數據,從而得以從“整合生物學”角度對樣品進行深入分析。通過創建定制的 SureSelect 設計便能達到這一目的,這種設計可以針對同一組基因,富集長達 6.8 Mb 的 DNA 和 RNA。安捷倫的 eArray 設計工具可以幫助用戶根據具體的實驗需求量身定制試劑盒。
安捷倫 SureSelect 平臺市場主管 Fred P. Ernani 博士說:“RNA 測序正迅速地成為轉錄組表達譜分析的強大工具。我們的 RNA 捕獲試劑盒能夠檢測到低頻事件,還能為研究人員提供穩定和經濟的目標 RNA 測序方式。我們的基因組 DNA 靶向序列捕獲系統在基因發現方面極為成功和高效,至今已有 30 多篇論文發表在高影響因子的期刊上。我們期待 RNA 試劑盒對于基因發現也能有同樣的影響。”
激酶組 RNA 試劑盒
除了定制的 SureSelect RNA 捕獲試劑盒,安捷倫還推出了 SureSelect 人激酶組 RNA 靶向序列捕獲試劑盒。這些試劑盒能夠對激酶和激酶調控的基因進行迄今最全面的分析。科研人員可以使用激酶組試劑盒對 DNA 和 RNA 進行富集,分析基因組變異對轉錄調控的影響。
這些試劑盒針對主流的下一代測序平臺進行了優化,包括 Illumina 基因組分析儀和 HiSeq 平臺以及 Life Technologies 的 SOLiD平臺。由于可以對樣品進行索引實現多樣本平行測序,而且所有試劑都與自動化操作兼容,因此工作流程可以輕松擴展。很快,安捷倫的 Bravo 自動化液體處理系統就會提供支持RNA 捕獲的全套自動化解決方案。
SureSelect RNA 捕獲試劑盒的定制版和目錄版可用于捕獲小于 200 Kb到不大于 6.8 Mb 之間的序列,產品包裝從 5 到 10000 次反應不等。
在《科學》雜志 12 月 17 日刊登的 2010 年十大科學突破中,SureSelect 靶向序列捕獲系統被其中兩項引用:“Reading the Neandertal Genome(解讀尼安德特人基因組)”和“Homing In on Errant Genes(外顯子組測序/罕見疾病基因)。